Ierobežota vienpakāpes darbībai: gala iesūkšanas sūkņi parasti ir ierobežoti ar vienpakāpes darbību. Tas nozīmē, ka tie var nebūt piemēroti lietojumiem, kuros nepieciešama augstspiediena sūknēšana vai vairāki spiediena paaugstināšanas posmi.
Zemāka efektivitāte augstspiediena lietojumiem: salīdzinot ar daudzpakāpju sūkņiem, gala sūkšanas sūkņiem var būt zemāka efektivitāte, ja runa ir par augstspiediena lietojumiem. Ja nepieciešams augsts spiediens, piemērotākas var būt citas sūkņu konfigurācijas, piemēram, daudzpakāpju sūkņi.
Iespējamās kavitācijas problēmas: noteiktos apstākļos gala sūkšanas sūkņi var būt jutīgi pret kavitāciju, kas ir tvaika burbuļu veidošanās un sabrukšana sūknī. Kavitācija var izraisīt sūkņa bojājumus un samazināt tā veiktspēju. Ir nepieciešams pienācīgi apsvērt darbības apstākļus un īstenot pasākumus, lai novērstu kavitāciju.
Samazināta efektivitāte ar viskoziem šķidrumiem: Darbojoties ar viskoziem šķidrumiem, tā efektivitāte var samazināties. Šķidruma augstāka viskozitāte var ietekmēt sūkņa efektivitāti un veiktspēju. Šādos gadījumos viskozu šķidrumu apstrādei piemērotāki varētu būt alternatīvi sūkņu veidi, piemēram, zobratu vai progresīvās dobuma sūkņi.
Lielāka jaudas patēriņa potenciāls liela mēroga operācijās: liela mēroga darbībām, kurām nepieciešams liels plūsmas ātrums, gala sūkšanas sūkņi var patērēt vairāk enerģijas, salīdzinot ar citām sūkņu konfigurācijām. Ir svarīgi ņemt vērā enerģijas prasības un ekspluatācijas izmaksas, kas saistītas ar sūkņa enerģijas patēriņu šādiem lietojumiem.
Nav piemērots apstrādei ar abrazīviem vai kodīgiem šķidrumiem bez atbilstošām modifikācijām: Standarta tipa sūkšanas sūkņi var nebūt piemēroti darbam ar abrazīviem vai kodīgiem šķidrumiem bez atbilstošām modifikācijām. Lietojot, kur šķidrumi satur cietas vielas vai ķīmiskas vielas, kas var izraisīt sūkņa komponentu bojājumus, var būt nepieciešami īpaši materiāli vai aizsargpārklājumi.
